竜巻の被害で母を亡くしたリズとエリーの姉妹。25年後、リズは気象学者となり、エリーは目の前で母を亡くしたショックから精神が病み、父と一緒に農場の実家に引きこもっていた。そんな中、リズは娘のベッキーを連れ、久しぶりに実家を訪れる。一方、国立測候所では二つの巨大竜巻の存在が確認され、対策チームがそれを追っていた。その二つの竜巻は、それぞれの進路を変えミズーリ州で衝突、巨大な嵐となり、加速しながら農場へと近づいていた。全てを跡形もなく消し去る、巨大トルネードの脅威。果たして彼女たちの運命は？！25年前の悲劇が再び訪れるのか…？！